殺菌滅藻劑與菌藻和微生物接觸后，快速斷開細菌和藻類蛋白質的鍵不可逆地抑治其生長、新陳代謝進而導致微生物菌藻的死亡，故對常見細菌、真菌、藻類等具有很強的抑治和殺滅作用。殺生效率高，降解性好，具有不產生殘留、操作安全、配伍性好、穩定性強、使用成本低等特點。同時殺菌滅藻劑并對對附著在管道壁上的生物粘泥有優異好的剝離效果，可作為粘泥剝離劑使用。

　　殺菌滅藻劑本身是沒有什么毒性的，所以在使用過程當中不會對人體產生危害，再就是對水質的影響也不是很大，這樣的性能特點，使得它可以在紡織、石油等領域當中發揮著重要作用。作為陽離子表面活性劑，殺菌滅藻性能強、效果明顯、適用范圍較為廣泛、并且還可以有效的控制住水中菌藻類的繁殖生長、具有交強的分散性。
　　在使用的時候殺菌滅藻劑的稀釋比例一般是消泡劑對稀釋為1：1或者是1:9都可以，根據實際情況而定，這樣可以便于改善消泡粒子大小之間的合理分布，有利于性能的發揮，在添加殺菌滅藻劑的時候要注意個人防護，畢竟屬于化學物品，所以在使用的時候要避免接觸到皮膚，使用時應佩戴手套和眼鏡。如有不慎，濺到皮膚上或眼睛里，立即用大量清水清洗，也可配制10 %亞硫酸氫鈉擦洗，及時就醫。

　　殺菌滅藻劑使用方法：在循環冷卻水中作生物粘泥的剝離劑用時，可投加150-300 mg/L。殺菌滅藻時視菌藻滋生情況，每隔3-7天投加50-100 mg/L。殺菌滅藻劑不能與其它氧化性殺生劑并用。